第36話(第1戦)

Xoth社の協力を得たダークロードは大部隊を率いて地球への侵攻を開始。
アステリズムは地球の防衛ラインを死守するべく、部隊を2つに分けての遊撃戦を展開、まずAチームの戦いが開始する。
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第36話(第2戦)

サン率いるAチームはリレイヤーを撃退する。
一方のミンタカ率いるBチームも敵を迎え撃つ。リレイヤーの中には黒いオリジナル・ワンが紛れていた。
第36話(第2戦)攻略

第37話(第1戦)

リレイヤーの攻撃で地球連合政府軍は壊滅状態に。テラとヒミコはアステリズムからはぐれ孤軍奮闘する。
そして二人は防衛ラインを突破して地球に迫るダークロード率いる本隊と交戦を始める。
第37話(第1戦)攻略

第37話(第2戦)

孤立していたテラとヒミコの元にアステリズムが到着。
ダークロードが乗る「ダークノア」との戦いが始まる。
第37話(第2戦)攻略

第38話

ネプチューンが覚醒したことにより太陽系惑星のスターチャイルドが揃い、アフロディーテが復活する。
オリジナル・ワンが生成するマイクロ・ブラックホールの力でアフロディーテを倒すべくアステリズムは月の古代遺跡へ向かう。
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第39話

地球を漂白するべく侵攻するアフロディーテだが、本来の力を取り戻してはいなかった。
アフロディーテが力を取り戻す前に決着をつけようとするアステリズムの前にダークナイトが立ち塞がる。
第39話攻略

第40話

地球を守るための作戦「ミッション・テラ」が発令され、アステリズムはアフロディーテ打倒を目指す。
そこに黒いオリジナル・ワンが攻撃を仕掛けてくる。
第40話攻略

第41話

先行してアフロディーテの所へ向かうテラとヒミコ。損傷したアステリズムも再び航行を開始。
人類の存亡をかけた決戦の幕が今開かれようとしていた。
第41話攻略

第42話(エピローグ)

厳密には第8章ではなく「終章」扱いのエピローグ。
戦闘は発生せず、これを見ることでエンディングへ。

クリアデータをセーブし、それをロードすることで新たにアステリズム航海記をプレイすることができる。
また、クリアデータが存在する状態でNEW GAMEを選択すると要素を引き継いで2周目をプレイできる。クリア特典・周回プレイを参照。