概要

本作では、任意に選ぶことができるルート分岐(例えば太平洋ルートとガリアルート)の他に、48話〜53話や56話〜57話は、それまでに取ってきた行動次第では隠しルートを通ることができるようになり、さらに終盤でフラグを立てることで、最終話やエンディングでも変化が起きます。
勘違いしないように断っておきますが、「通常ルートか隠しルートかの分岐」にかかわるポイントと「エンディングの分岐」にかかわるポイントはそれぞれ独立しており、共有したりするわけではありません。

48話以降の分岐について

47話クリア時点で条件を満たしていれば通常ルートと隠しルートのどちらを進むか選べるようになり、ポイントが少し足りないなら自動的に隠しルートになり、ポイントが大きく足りないなら自動的に通常ルートとなります。また、二週目以降の場合無条件で選択が出現します。

ランド編
シナリオ 条件 フラグポイント
太平洋ルート16話「交差する決意」 キラを撃墜する +1
ランド編29話「アウトサイダー」 ザフト小隊が3小隊以上残存している状態でイザークを撃破 +1
〃 ザフト小隊を撃墜せずにイザークのみ撃墜、ポイントは上と重複する +2
ランド編30話「アクペリエンス」 キラ、バルトフェルド、マリュー、エニルが敵を1機も撃墜せずにシナリオクリア +1
ランド編36話「示される明日」 シンがステラと戦闘する +1
〃 シンがステラを撃墜する +2
〃 キラがステラを撃墜する -1
ランド編38話「仕組まれた決戦」 シンを撃墜する +1
〃 キラが撃墜される -1
共通43話「運命と自由と」 アスランを撃墜せず4PPになる +1
〃 シンがアスランを撃墜する -1
セツコ編
シナリオ 条件 フラグポイント
セツコ編2話「怒れる瞳」 選択で「強奪されたガンダムを取り押さえる」を選択 +1
セツコ編8話「世界の終わるとき」 アレックスでサトーを撃墜する +1
太平洋ルート16話「交差する決意」 キラを撃墜する +1
セツコ編29話「灼熱の海原」 キラを撃墜する +1
〃 マリューを撃墜する +1
ジブラルタル基地ルート35話「戦闘神の影」 シナリオをクリアする +1
セツコ編36話「慟哭の星空」 ステラの加入条件を満たす、詳しくは隠し機体、パイロットについてのページ参照 +1
セツコ編38話「踊る悪夢」 キラがいる状態でシンが撃墜される +2
〃 シンとキラが戦闘せずにキラを撃墜する、ポイントは上と重複する +1
共通43話「運命と自由と」 アスランを撃墜せず4PPになる +1
〃 シンがアスランを撃墜する -1
ポイントによる分岐(両主人公共通)
ポイント 概要
ポイント10以上、かつSRポイント36以上 47話クリア後に選択が出て通常ルートか隠しルートか選択できる
ポイント7〜9、かつSRポイント36以上 隠しルートに進む
上二つの条件に当てはまらない 通常ルートへ
二週目以降のプレイ ポイントは関係なしにルートを選択可能

最終話とエンディングの分岐

最終話とエンディングの変化に関しても蓄積したポイントにより変化します。共通シナリオと通常ルートと隠しルートで分けて説明。

共通シナリオ、主人公別シナリオ
シナリオ 条件 フラグポイント
共通41話「クロス・ポイント」 チラム軍出現までエマーン艦以外の敵を撃墜しない +1
〃 チラム軍出現までにエマーン艦以外の敵を全て撃墜する -1
〃 オルソンでアテナを説得する +1
共通42話「終章開幕」 アキ生存フラグを立てる、詳しくは人間爆弾についてのページ参照。 +1
共通43話「運命と自由と」 アスランを撃墜せず4PPを迎える +1
〃 レイでアスランを撃墜する -1
共通44話「舞い降りる太陽」 ミディフォーが目的地到達、アフロディアを撃墜、ネグロスを撃墜のいずれかの条件を満たしてグラヴィオンを登場させる +1
〃 ソルグラヴィオン登場後2ターン以内に人口太陽を撃墜する +1
〃 アクエリオンで双翅を撃墜する +1
共通45話「遺産の継承者」 ジロンかホランドが目的地に到達 +1
〃 黄色の第三軍が1機も撃墜されずにシナリオをクリア +1
共通46話「混迷の中の正義」 4ターン以内に敵を12小隊以上撃墜する +1
ランド編47話「俺達の行き先」 ランドがアサキムと戦闘する +1
セツコ編47話「カウント・ダウン」 4ターン以内にデンゼルとトビーを撃墜する +1
共通55話「永遠に輝け、僕らの星よ」 シャギアを撃墜する +1
〃 オルバを撃墜する +1
〃 ギンガナムを撃墜する +1
共通58話「メモリーズ」 選択肢で「メモリーを捨て、シティで生きていく」を選ぶ -15
通常ルートでのフラグポイント
シナリオ 条件 フラグポイント
通常ルート48話「裏切りの月光」 全ての敵を撃墜する -1
通常ルート49話「絶望の光、希望の灯」 カミーユ、クワトロ、エマ、ファのうち誰かがレコアと戦闘し、両者撃墜されない +1
通常ルート50話「私はD.O.M.E.……」 シャギアとオルバを同時に撃墜する +1
通常ルート51話「紅い道」 両翅を撃墜する +1
〃 グレンを撃墜する -1
通常ルート53話「歪んだ裁き」 風見博士のHPを2000以下にする +1
通常ルート56話「最期の力」 シンがいる状態で、ラクスでルナマリアを説得する +1
〃 ルナマリアを撃墜する -1
〃 ハマーンを撃墜する +1
通常ルート57話「星に願いを」 音翅と頭翅をどちらも撃墜する +1
隠しルートでのフラグポイント
シナリオ 条件 フラグポイント
隠しルート48話「楽園の追放者」 アランを撃墜する +1
隠しルート49話「幻想のメトロポリス」 ベックがいる状態でビッグデュオ・インフェルノを撃墜する +1
隠しルート50話「ヒトの心、テンシの夢」 両翅を撃墜する +1
〃 グレンを撃墜する -1
〃 詩翅を撃墜せずにシナリオクリア -1
隠しルート51話「決別」 カミーユ、クワトロ、エマ、ファのうち誰かがレコアと戦闘し、両者撃墜されない +1
隠しルート52話「黒歴史の真実」 シャギアとオルバを同時に撃墜する +1
〃 ギンガナムのHPを50%以下にする +1
隠しルート57話「終末の光」 音翅と頭翅をどちらも撃墜する +1
ポイントによる変化(両主人公共通)
ポイント 概要
ポイントが18以上 ランド編、セツコ編それぞれの最終話へと進む。59話で選択肢が出て、どちらを選んだかによりエンディングが変化する。
ポイントが7〜17 ランド編、セツコ編それぞれの最終話へと進む。
ポイントが6以下 ランド編、セツコ編どちらでも特殊な最終話「果てなき戦いの環へ」と進む。59話で選択肢が出て、どちらを選んだかによりエンディングが変化する。