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スキルツリーは序盤、初めて調合した時から利用可能になります。スキルツリーではSPを消費してレシピやスキルを習得できます。SPは調合したりクエスト、イベントを達成することで獲得できます。スキルツリーで項目を習得すると隣接するスキルを習得できるようになります。
SPがあってもロックされているスキルは習得できません。ロックされている条件で最も多いのは遺跡の欠片の解明のノルマ。遺跡を探索し、遺跡の欠片の謎を解き明かすことでロックが解除されます。

| 名称 | SP | 説明 | ロック解除 |
|---|---|---|---|
| 爆粉うに | 100 | 爆粉うにのレシピを習得 | - |
| グラスビーンズ | 100 | グラスビーンズのレシピを習得 | - |
| 中和剤 | 100 | 中和剤・赤、中和剤・青、中和剤・黄、中和剤・緑のレシピを習得 | - |
| フラム | 150 | フラムのレシピを習得 | - |
| プラジグ | 150 | プラジグのレシピを習得 | - |
| レヘルン | 150 | レヘルンのレシピを習得 | - |
| ルフト | 150 | ルフトのレシピを習得 | - |
| SP獲得量アップ+10% | 200 | 調合時のSP獲得量が10%アップ | - |
| インゴットセット | 250 | インゴットと武器のレシピを習得 | - |
| ハチミツセット | 250 | ハチミツと小麦粉のレシピを習得 | 1の遺跡の欠片解明 |
| 素材加工セット | 250 | 研磨剤と錬金繊維のレシピを習得 | - |
| 薪割り斧 | 250 | 薪割り斧のレシピを習得 | 1の遺跡の欠片解明 |
| 草刈り鎌 | 250 | 草刈り鎌のレシピを習得 | - |
| クロース | 250 | クロースのレシピを習得 | - |
| ゼッテル | 250 | ゼッテルのレシピを習得 | - |
| ミックスオイル | 250 | ミックスオイルのレシピを習得 | - |
| ゼラチンパウダー | 250 | ゼラチンパウダーのレシピを習得 | - |
| 通常採取ランクアップ+1 | 250 | 通常採取時の採取ランクが1アップする | - |
| 杖採取ランクアップ+1 | 250 | 杖採取時の採取ランクが1アップする | - |
| 杖採取品質アップ+20 | 250 | 杖採取時の採取物の品質が20増える | - |
| 投入回数アップ+1 | 300 | 調合時の投入回数が1回分増える | - |
| 杖採取量アップ+1 | 300 | 杖採取時の採取物が1つ増える | - |
| 通常採取品質アップ+20 | 300 | 通常採取時の品質が20増える | - |
| SP獲得量アップ+20% | 300 | 調合時のSP獲得量が20%アップ | - |
| 泡雲の弾丸 | 350 | 泡雲の弾丸のレシピを習得 | - |
| カクテルレープ | 400 | カクテルレープのレシピを習得 | 5の遺跡の欠片解明 |
| 植物の種 | 400 | 植物の種のレシピを習得 | - |
| 虫取り網 | 400 | 虫取り網のレシピを習得 | - |
| 釣り竿 | 400 | 釣り竿のレシピを習得 | 2の遺跡の欠片解明 |
| 火薬のもと | 400 | 火薬のもとのレシピを習得 | - |
| ヒーリングチップ | 400 | ヒーリングチップのレシピを習得 | 3の遺跡の欠片解明 |
| エネルジアニカ | 400 | エネルジアニカのレシピを習得 | - |
| 通常採取量アップ+1 | 400 | 通常採取時の採取物が1つ増える | - |
| 杖採取量アップ+1 | 400 | 杖採取時の採取物が1つ増える | - |
| レシピ変化 | 500 | レシピ変化が発生するようになる | - |
| 投入回数アップ+1 | 500 | 調合時の投入回数が1回分増える | - |
| 品質上限の解放「300」 | 500 | 品質300までの調合品が作れるようになる | 2の遺跡の欠片解明 |
| リビルドレベルアップ+5 | 500 | リビルドレベルが5アップする | - |
| SP獲得量アップ+30% | 500 | 調合時のSP獲得量が30%アップ | - |
| 神秘の羽衣 | 600 | 神秘の羽衣のレシピを習得 | - |
| うにハリケーン | 600 | コアドライブ「うにハリケーン」を習得 | コアドライブ解放 |
| 通常採取ランクアップ+1 | 600 | 通常採取時の採取ランクが1アップする | - |
| 通常採取量アップ+1 | 600 | 通常採取時の採取物が1つ増える | - |
| 杖採取ランクアップ+1 | 600 | 杖採取時の採取ランクが1アップする | - |
| マーブルストーン | 600 | マーブルストーンのレシピを習得 | 15の遺跡の欠片解明 |
| ホーリーナット | 600 | ホーリーナットのレシピを習得 | - |
| エターナルループ | 600 | コアドライブ「エターナルループ」を習得 | コアドライブ解放 |
| フェザードラフト | 600 | フェザードラフトのレシピを習得 | - |
| リビルド・ジェム還元 | 750 | リビルド・ジェム還元が行えるようになる | - |
| フラムロッド | 750 | フラムロッドのレシピを習得 | 5の遺跡の欠片解明 |
| オーロラウェーブ | 750 | コアドライブ「オーロラウェーブ」を習得 | コアドライブを解放 |
| リビルドレベルアップ+8 | 800 | リビルドレベルが8アップする | - |
| リビルドレベルアップ+8 | 800 | リビルドレベルが8アップする | - |
| 通常採取品質アップ+30 | 800 | 通常採取時の採取物の品質が30増える | - |
| 品質上限の解放「600」 | 800 | 品質600までの調合品が作れるようになる | - |
| 杖採取品質アップ+30 | 800 | 杖採取時の採取物の品質が30増える | - |
| ルナーランプ | 800 | ルナーランプのレシピを習得 | 15の遺跡の欠片解明 |
| 風の精の靴 | 800 | 風の精の靴のレシピを習得 | 10の遺跡の欠片解明 |
| 創生の槌 | 800 | 創生の槌のレシピを習得 | - |
| ホロターゲティング | 900 | コアドライブ「ホロターゲティング」を習得 | コアドライブ解放 |
| テスタメントメテオ | 900 | コアドライブ「テスタメントメテオ」を習得 | コアドライブ解放 |
| リビルドレベルアップ+8 | 1000 | リビルドレベルが8アップする | - |
| 投入回数アップ+1 | 1000 | 調合時の投入回数が1回分増える | 15の遺跡の欠片解明 |
| コアドライブ | 1000 | コアドライブが使えるようになる | 古式秘具を発見 |
| コアクリスタル調整 | 1000 | コアクリスタル調整が行えるようになる | 地下乙女の墓所をクリア |
| エッセンス | 1000 | エッセンス精製が行えるようになる | 水底の星都をクリア |
| エボルブリンク | 1000 | エボルブリンクが行えるようになる | 古代マナ工房をクリア |
| リビルドレベルアップ+10 | 1200 | リビルドレベルが10アップする | - |
| 超純水 | 1200 | 超純水のレシピを習得 | - |
| 女神の飲みさし | 1200 | 女神の飲みさしのレシピを習得 | - |
| 天使の抱擁 | 1200 | コアドライブ「天使の抱擁」を習得 | コアドライブ解放 |
| グラビティプレス | 1200 | コアドライブ「グラビティプレス」を習得 | コアドライブ解放 |
| 根絶の劇薬 | 1200 | コアドライブ「根絶の劇薬」を習得 | コアドライブ解放 |
| アイテム複製 | 1500 | アイテム複製が行えるようになる | - |
| 投入回数アップ+1 | 1500 | 調合時の投入回数が1回分増える | 20の遺跡の欠片解明 |
| リビルドレベルアップ+15 | 1500 | リビルドレベルが15アップする | - |
| 品質上限の解放「999」 | 1500 | 品質999までの調合品が作れるようになる | 15の遺跡の欠片解明 |
| 光のミスト | 1500 | 光のミストが手に入るようになる | - |
| 賢人の宝典 | 1500 | 賢人の宝典のレシピを習得 | - |
| ダークプロージョン | 1500 | コアドライブ「ダークプロージョン」を習得 | - |
| リビルドレベルアップ+15 | 1800 | リビルドレベルが15アップする | - |
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